Identificaci?n de microduplicaciones y microdeleciones en el cromosoma X de pacientes con retardo mental idiop?tico mediante MLPA
- Authors
- Neira Molina, Vivian Alejandra
- Format
- DoctoralThesis
- Status
- publishedVersion
- Description
Background Mental retardation (MR) is a permanent disability that requires specialized medical care and important social demands, given its frequency, severity and bio-social impact as well as the lack of specific treatments. The MR can be sporadic or familiar, and occur as an isolated feature or in association with congenital anomalies in several syndromes. In general population, prevalence of MR of any degree is close to 3%, most with mild or moderate MR, and a minority with severe MR. Etiology of MR includes genetic, infectious, toxic and perinatal factors; however, and despite progress in diagnosis methods, it is not possible to identify the cause of MR in more than 50% of patients, who are catalogued in the idiopathic MR (IMR) category. It should be noted that etiology is achieved more frequently in severe MR, and it is mostly of genetic nature. X-linked mental retardation (XLMR) affects mainly male, with a male to female ratio of 1.3:1. Among these, non-syndromic forms represent 2/3 of all cases. Nowadays it is known that at least 25 genes correspond to non-syndromic MR, and 42 to syndromic forms. Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) is a useful tool to diagnose patients with XLMR, as it is able to detect the variation in the number of copies of several genes in only one experiment. Objective To identify the frequency of microduplications and microdeletions in the X chromosome from male patients with IMR. Methodological design Cross-sectional and descriptive study. Were tested 100 male patients with syndromic and non-syndromic IMR forms with normal karyotype and negative X Fragile test. In addition15 healthy men were also included as reference group. The DNA was extracted using Qiagen kit (Gentra). MLPA was carried out following MRC-Holland protocol. Results and discussion All healthy males showed a normal peak profile. In the patients group, a case presenting duplication in SLC6A8 and GDI1 genes located in Xq28 region was found. By FISH we identified that this gain is located in a small supernumerary marker chromosome in mosaic. This fact can explain the patient?s phenotypic variations. MLPA also enable us to identify a microdeletion in a patient?s Y chromosome.
Antecedentes El retardo mental (RM) es una discapacidad permanente que requiere aten- ci?n m?dica especializada e importantes exigencias sociales, dadas su frecuencia, gravedad y repercusiones bio-sociales as? como la carencia de tratamientos espec?ficos. El RM puede ser espor?dico o familiar y presentarse como rasgo aislado o asociado con anomal?as cong?nitas en numerosos s?ndromes. En poblaci?n general, la prevalencia de RM de cualquier grado es cercana al 3%; la mayor?a con RM leve o moderado y la minor?a con RM grave. La etiolog?a del RM incluye factores gen?ticos, infecciosos, t?xicos y perinatales; sin embargo, y a pesar de los avances en m?todos de diagn?stico, no es posible identificar la causa del RM en m?s del 50% de los pacientes, los cuales son ubicados en la categor?a de RM idiop?tico (RMI). Cabe precisar que el diagn?stico etiol?gico se logra con mayor frecuencia en el RM grave y m?s com?nmente es de ?ndole gen?tica. La forma de RM ligado al X (RMLX) afecta principalmente a varones, con una relaci?n var?n:mujer de 1.3:1. Entre ?stas, las formas no sindr?micas representan los 2/3 de todos los casos. Actualmente se conoce que por lo menos 25 genes corresponden a formas no sindr?micas y 42 a formas sindr?micas. La amplificaci?n m?ltiple de sondas dependientes de ligasa (MLPA por sus siglas en ingl?s) es una herramienta ?til para el diagn?stico de pacientes con RMLX ya que es capaz de detectar la variaci?n en el n?mero de copias de varios genes en un s?lo experimento. Objetivo Identificar la frecuencia con la que ocurren microduplicaciones y microdeleciones en el cromosoma X de pacientes varones con RMI. Dise?o metodol?gico Estudio transversal, descriptivo. Se incluyeron 100 pacientes varones con RMI de las formas sindr?mica y no sindr?mica con cariotipo normal y estudio de X Fr?gil negativo. Se incluyeron adem?s 15 varones sanos como referencia. El ADN se extrajo utilizando el kit Qiagen (Gentra). La MLPA se llev? a cabo siguiendo el protocolo de MRC-Holland. Resultados y discusi?n Todos los varones sanos mostraron un perfil de picos normal. En el grupo de pacientes se encontr? un caso que presenta una duplicaci?n de los genes SLC6A8 y GDI1, ubicados en la regi?n Xq28. Por FISH identificamos que la ganancia se encuentra en un peque?o marcador supernumerario en mosaico, esto puede explicar las variaciones fenot?picas en el paciente. MLPA nos permiti? adem?s identificar una microdeleci?n en el cromosoma Y de un paciente.
- Publication Year
- 2013
- Language
- spa
- Topic
- GEN?TICA HUMANA
BIOLOG?A MOLECULAR
RETARDO MENTAL LIGADO AL X
MLPA
MECP2
- Repository
- Repositorio SENESCYT
- Rights
- openAccess
- License