Estudio preliminar de la diversidad genética del capulí (Prunus serotina) en 5 Provincias de la Región Andina de Ecuador mediante el uso de marcadores moleculares microsatélites.
- Authors
- Guadalupe López, Juan José
- Format
- BachelorThesis
- Status
- publishedVersion
- Description
Black cherry (Prunus serotina) is a tetraploid species that belongs to the Rosaceae family, native to North America, but also found in Central America, Ecuador and Peru. This species is widely spread throughout the Ecuadorian highlands and has a great commercial value for local farmers due to its fruit and its use as a windbreak curtain in agricultural fields. This research represents the first study of genetic diversity for P. serotina, in 5 provinces of the Ecuadorian highlands using 8 heterologous microsatelite molecular markers from other species of the genus Prunus. A total of 129 accessions were analyzed and a total of 48 different alleles were found in the 8 analyzed loci. With these data, a binary matrix was generated with which a dendogram and a principle coordinate analysis (PCoA) were built. The results indicate a high intraspecific genetic diversity and a random distribution of capuli throughout the provinces evaluated. This preliminary analysis shows the need to improve the clustering reliability through the use of a higher number of loci, and evaluate the population with specific statistical analysis for tetraploid species. These initial data show a high probability to perform breeding programs and thus increase the farming and conservation potential of this biological resource.
El capulí (Prunus serotina) es una especie tetraploide de la familia Rosaceae, originaria de Norteamérica, presente también en Centro América, Ecuador y Perú. La especie está distribuida ampliamente en la sierra ecuatoriana y tiene un gran valor para granjeros locales por la comercialización de su fruto y para crear cortinas rompe vientos en los campos agrícolas. Esta investigación constituye el primer estudio de diversidad genética para P. serotina, realizado en 5 provincias de la sierra ecuatoriana mediante el uso de 8 marcadores moleculares microsatélites heterólogos, provenientes de otras especies del género Prunus. Se analizó un total de 129 accesiones de capulí y se encontró un total de 48 alelos distintos en los 8 loci analizados. Con estos datos se generó una matriz binaria con la que se construyó un dendograma y un análisis de coordenadas principales (PCoA). Los resultados indican una alta diversidad genética intraespecífica, pero no se pudo establecer un patrón de agrupación por provincia, sino más bien una distribución aleatoria. Estos resultados preliminares muestran la necesidad de aumentar la fiabilidad del agrupamiento mediante el análisis de un mayor número de loci y evaluando la población con pruebas estadísticas específicas para especies tetraploides. Estos primeros datos muestran una alta posibilidad de realizar programas de mejoramiento y así ayudar a aumentar el potencial de explotación y conservación de este recurso biológico.
- Publication Year
- 2012
- Language
- esp
- Topic
- Biotecnología Agrícola
Tecnología
TECNOLOGÍA QUÍMICA
- Repository
- Repositorio Universidad San Francisco de Quito
- Get full text
- http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/1976
- Rights
- openAccess
- License
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/