Estudio de diversidad genética de Callithrix pygmaea en la amazonía ecuatoriana mediante el uso de microsatélites (SSR: Short Sequence Repeats).

 

Authors

Terán Egüez, Claudia

Format

BachelorThesis

Status

publishedVersion

Description

Callithrix pygmaea belongs to Cebidae family and Callitrichinae subfamily. Pygmy marmosets have a small size, dark golden hair and hands and feet similar to those of a squirrel. They inhabit river edge forests of the Amazon. They feed on certain tree gum, insects, fruits and flowers. Over the last years, the Amazon has been occupied by the human being. The fragmentation of the forests has affected pygmy marmosets´ regular migration between groups and populations. A preliminary study was conducted to estimate the vulnerability of C. pygmaea in two populations (Sehuaya y Sacha). 46 pygmy marmosets´ feaces samples were collected, 28 of them belonged to Sehuaya population and 18 belonged to Sacha population. In addition, 3 pygmy marmosets´ hair samples were collected from the Sehuaya population. The DNA samples extracted from hair follicle were used as positive controls. Nine microsatellite regions were amplified by PCR using primers reported for other Callitrichine species (Nievergelt, et al., 1998). ). The results obtained by Nieto et al. (2011) in San Pablo population were also included in the statistical analysis. The results showed that each locus analyzed had a maximum of 3 alleles. The Hardy-Weinberg equilibrium test suggests that in Sehuaya population inbreeding could be occurring. Observed heterocigosity was usually higher than expected heterocigosity, showing that there is still some genetic diversity in Sacha and San Pablo. AMOVA test proved that the genetic diversiy within a population is higher than between populations. This makes clear that there is a low migration of individuals between populations. Nei´s genetic distance was 0,168 between Sehuaya and Sacha, 0,698 between Sacha and San Pablo and 2,124 between Sehuaya and San Pablo. Principal coordinates analysis (PCA) showed that there might be genetic flow between Sehuaya and Sacha and between Sacha and San Pablo. This might have been caused by the capture of individuals by the people living in the area. This could facilitate the “migration” between populations. These results reveal a complex reality for pygmy marmosets because of their habitat reduction and low genetic diversity. For this reason, it would be necessary to carry out a broader study in which more primers are used, and in this way try to understand better C. pygmaea´s genetic situation and propose new conservation programs.
La especie Callithrix pygmaea pertenece a la familia Cebidae y a la subfamilia Callitrichinae. Los leoncillos son de pequeño tamaño, su pelaje es dorado oscuro y sus manos y pies similares a los de una ardilla. Habitan en bosques de galería de la Amazonía, en ciertos árboles de los cuales se alimentan de su exudado, insectos, frutas y flores. Debido a la alta intervención de la Amazonía por parte del ser humano, los leoncillos están siendo afectados por la fragmentación de los bosques. Poblaciones o grupos de leoncillos están aislados, impidiendo una dispersión regular de individuos entre grupos o poblaciones. Para poder estimar la vulnerabilidad de C. pygmaea, se realizó un estudio preliminar para evaluar la diversidad genética de esta especie en dos poblaciones (Sehuaya y Sacha). Se colectaron en total 46 muestras de heces de leoncillo, de las cuales 28 pertenecían a la población de Sehuaya y 18 a la población de Sacha. Además se colectaron 3 muestras de pelo de leoncillo de la población de Sehuaya. Las muestras de ADN a partir de pelo sirvieron como control positivo. Se amplificaron nueve regiones microsatélite con primers reportados para otra especie de Calitrichinos (Nievergelt, et al., 1998). Para realizar el análisis estadístico se incluyeron los datos colectados por Nieto et al. (2011) de la población de San Pablo. Los resultados obtenidos mostraron que existen hasta 3 alelos por locus analizado. El test de equilibrio de Hardy-Weinberg sugiere que en la población de Sehuaya puede haber endogamia. La heterocigosis observada fue generalmente más alta que la esperada mostrando que aún existe algo de diversidad genética en las poblaciones de Sacha y San Pablo. La prueba de AMOVA evidenció una diversidad genética más alta en una misma población que entre poblaciones, sugiriendo una baja migración de individuos entre poblaciones. La distancia genética de Nei fue de 0,168 entre las poblaciones de Sehuaya y Sacha, de 0,698 entre Sacha y San Pablo y de 2,124 entre Sehuaya y San Pablo. El análisis de coordenadas principales (PCA), mostró que podría haber flujo génico entre las poblaciones de Sehuaya y Sacha y entre Sacha y San Pablo. Este flujo génico puede deberse a la captura de individuos por parte de las personas de la región, los cuales facilitarían la “migración” entre poblaciones. Los resultados de este estudio presentan una realidad compleja para los leoncillos en cuanto a disminución de hábitat y diversidad genética. Por este motivo sería necesario realizar una investigación en la que se utilicen más pares de primers, para comprender mejor la situación genética de C. pygmaea y definir planes de conservación.

Publication Year

2013

Language

esp

Topic

Tecnología ambiental
Biotecnología
Tecnología

Repository

Repositorio Universidad San Francisco de Quito

Get full text

http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/1939

Rights

openAccess

License

http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/